Die Philosophie der Osteopathie ist, dass der Körper als umfassendes Ganzes funktioniert. Struktur und Funktion sind untrennbar miteinander verbunden. Der Körper verfügt über Selbstheilungsmechanismen. Wenn der Körper sein physisches Gleichgewicht verliert, muss der Körper dies kompensieren. Der Osteopath versucht dieses physische Gleichgewicht wieder herzustellen, damit der Körper wieder normal funktioniert. Ist das Gleichgewicht wieder erreicht, müssen auch die Funktionen wieder hergestellt werden. 
Bei chronischen Beschwerden kann Osteopathie eine Linderung bringen, ganze Heilung ist oft nicht möglich. Das Prinzip der Osteopathie basiert auf angewandten Kenntnissen der Anatomie, Physiologie und Pathologie.

In der Praxis bedeutet das, dass ein Problem nicht nur lokal betrachtet wird. Das Tier wird insgesamt untersucht. Jede Struktur kann irgendwo anders ein Problem verursachen. Dieses Prinzip führt den Osteopath oft zur Wirbelsäule (bzw. zum Rückenmark), die eine zentrale Rolle als Körperachse spielt, aber auch das Nervensystem - sowohl peripher als auch autonom - beherbergt.
Craniosakrale Osteopathie und Faszientechniken können dabei auch genützt werden.